杜邦分析体系的缺点是不能区分经营性资产和非经营性资产的盈利能力，不能反映经营性资产获取利润的能力。因为企业的净利润包括主营业务利润和其他利润，企业的总资产既包括经营性资产，也包括非经营性资产。但是，在使用杜邦分析体系时，并没有对经营性资产创造利润的能力进行分析。
为什么要分析经营性资产创造利润的能力？
如果企业总资产10亿元，经营性资产8亿元，非经营性资产2亿元。经营性资产收入300万元，非经营性资产收入700万元。
我们会发现，经营性资产获取收益的能力远不如非经营性资产，企业的核心竞争力应该在主营业务和经营性资产的盈利能力上。
如果企业使用杜邦分析体系，这个问题就无法在指标分析中体现出来。特别是很多上市公司会利用非主营利润粉饰主营业务。在这种情况下，许多投资者会被公司的财务报表所欺骗。
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